Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Samhd1Q60710 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Samhd1Q60710 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms