Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sin3aQ60520 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sin3aQ60520 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms