Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Myh1Q5SX40 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms