Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sft2d1Q5SSN7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms