Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms