Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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