Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdp2Q504M2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Pdp2Q504M2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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