Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk4Q3V129 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk4Q3V129 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms