Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cldn34b4Q3V0X2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn34b4Q3V0X2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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