Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp48Q3V0C5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms