Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttc9Q3V038 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc9Q3V038 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc9Q3V038 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ttc9Q3V038 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ttc9Q3V038 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms