Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Skap2Q3UND0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Skap2Q3UND0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms