Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mier3Q3UHF3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms