Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms