Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LbrQ3U9G9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms