Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q3U595 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q3U595 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Q3U595 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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