Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Serac1Q3U213 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms