Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rufy4Q3TYX8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rufy4Q3TYX8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rufy4Q3TYX8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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