Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms