Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLP5

Echdc2, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc2Q3TLP5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Echdc2Q3TLP5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms