Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Smarca4Q3TKT4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarca4Q3TKT4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms