Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trappc13Q3TIR1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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