Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp1aQ2LKU9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nlrp1aQ2LKU9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms