Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fam171bQ14CH0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms