Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd2Q0VET5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd2Q0VET5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms