Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rab42Q0PD08 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rab42Q0PD08 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms