Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms