Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TrioQ0KL02 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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