Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Znf541Q0GGX2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms