Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pate4Q09098 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms