Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Tgm3Q08189 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tgm3Q08189 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms