Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col9a2Q07643 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms