Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PtprgQ05909 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms