Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms