Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1sQ02789 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms