Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GscQ02591 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GscQ02591 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms