Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EgfrQ01279 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
EgfrQ01279 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms