Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HmgcrQ01237 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HmgcrQ01237 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms