Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Grin2cQ01098 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms