Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pde1bQ01065 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pde1bQ01065 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms