Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VegfaQ00731 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VegfaQ00731 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms