Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pax8Q00288 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms