Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gbp10Q000W5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gbp10Q000W5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms