Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tarbp2P97473 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tarbp2P97473 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms