Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lig3P97386 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms