Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Taf1bP97358 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms