Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gabpb2P81069 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms