Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp8a1P70704 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp8a1P70704 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms