Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SbdsP70122 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SbdsP70122 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SbdsP70122 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms