Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Acta1P68134 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms